El mandato de la Oficina de Auditora y Supervisión (OA), anteriormente llamada la Oficina de Auditoría Interna, incluye ocuparse de todos los asuntos relacionados con la investigación de prácticas irregulares en las actividades y operaciones del FIDA. En la OA, la Sección de Investigaciones se ocupa de todas las investigaciones y actúa como secretaría del Comité de Sanciones.

La OA ha asumido las funciones de investigación de las que anteriormente se ocupaba el Comité de Supervisión del FIDA.