La recherche est une condition indispensable pour atteindre les objectifs de développement durable. Le FIDA s'associe à divers instituts de recherche agricole et établissements d'enseignement supérieur dans le but d'élargir la base des connaissances disponibles sur les solutions ayant fait leurs preuves et sur les bonnes pratiques, mais aussi d'améliorer la sécurité alimentaire. Les éléments factuels issus de ces partenariats profitent ensuite aux opérations du FIDA.

La publication phare du FIDA, le "Rapport sur le développement rural", est rédigé en collaboration avec les partenaires de recherche, qui fournissent les données de base pour le rapport.

En vue d'élargir le programme de recherche, le FIDA prépare une initiative conjointe avec l'Organisation des Nations Unies pour l'alimentation et l'agriculture (FAO), le Centre pour les données du développement, organisme de la Banque mondiale basé à Rome, et le Conseil indépendant pour les sciences et les partenariats du Groupe consultatif pour la recherche agricole internationale (GCRAI) afin d'élaborer ensemble un programme de recherche collaborative visant à favoriser les progrès vers la réalisation des objectifs de développement durable 1 et 2 en milieu rural.

Le FIDA joue aussi un rôle majeur dans plusieurs réseaux et plateformes de savoirs qui sont à l'avant-garde de la recherche au service du développement agricole et il construit de nouvelles collaborations pour améliorer l'accès à l'information, aux financements et à l'analyse des risques.