Le FIDA a commencé à travailler avec les Comores en 1984.

À ce jour, il a appuyé six programmes dans le pays pour un montant total de 42,9 millions de dollars (prêt du FIDA 23,1 millions de dollars), qui ont bénéficié à environ 60 855 ménages ruraux pauvres.

Le FIDA attend actuellement l'approbation par le Parlement comorien du programme en cours : Projet d’appui à la productivité et à la résilience des exploitations agricoles familiales.